1、通道接口性质不同
支付宝v2是电脑网站+手机网站属于电商接口，不需要营业执照不限额，异地交易不会限制，抗风控耐用。
支付宝v1是线下支付接口，适合线下收款使用或者线上小额的收款。
2、费率不同
支付宝v2平台费率正规行业2%（包含支付宝官方的0.6%）
支付宝v1平台费率正规行业1% （不包含支付宝官方0.6%）
3、用户体验不同
支付宝v2是电脑网站+手机网站原生接口，手机唤醒更流畅。
支付宝v1是线下接口模拟，手机可以唤醒支付宝app，但部分浏览器可能失效，比如：百度浏览器。
4、其他不同
支付宝v2个人支付宝不支持花呗，支持信用卡。如果是企业支付宝开通支付宝v2支持花呗+信用卡。
支付宝v1大部分支持花呗+信用卡。
如何选择？
首选推荐：支付宝v2，如果是线上网站收款，都推荐支付宝v2，不过支付宝审核严格，请有需要的用户联系客服审核申请支付宝v2。
支付宝v1的缺点总结一下：
1）支付宝v1是线下接口，异地交易容易限制。（通常表现为：1、收到支付宝官方提醒账户异常，延迟3日或更长时间结算，或者直接清退商户。2、额度为0，无法收款）
2）申请比较困难，部分会提示账户风险，无法开通。
3）如果没有营业执照会限额，有的甚至直接额度为0，需要有营业执照才能恢复额度。
如果交易量很小，每天偶尔收几笔，用支付宝v1也是没啥问题的。
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重要说明（请仔细阅读后根据自己需求再联系）：
支付宝v2.0仅限老用户和真正对支付宝有需求的合规用户。
支付宝v2.0不是支付宝当面付，是真正的支付宝电脑+手机网站支付（暂时仅支持个人申请，不需要营业执照），不会出现风险限制和延迟结算的情况，已经清退的支付宝账号暂时无法申请。
结算是D0，即时到账。
平台费率：2%（包含支付宝官方的0.6%）支付宝官方费率由我方代缴。举例，100元交易，平台充值余额扣除2元，实际到账100元。
支付宝v2属于超级稀缺资源，市面上能做的屈指可数，并且价格已经高到离谱（有其他平台500元开户），请大家正确认识价值，根据自己的需求评估其价值，不要非议。